De EU heeft als voorwaarde voor toekenning van derogatie gesteld dat jaarlijks minstens 5% van de deelnemende bedrijven gecontroleerd moet worden. De NVWA heeft aangegeven dat dit najaar nog een aanzienlijk deel van deze controles uitgevoerd zal moeten worden.
Voor derogatiedeelnemers is het van belang om te kijken of aan de voorwaarden is voldaan. Een belangrijk punt daarbij is of het bemestingsplan nog actueel is. Wijzigingen dienen in principe binnen zeven dagen doorgevoerd te worden. Het gaat hier vooral om die wijzigingen die invloed hebben op het toe te passen bemestingsadvies of op de relatie tussen bemesting en de gebruiksnormen. Deze wijzigingen moeten doorgerekend worden, inclusief een berekening of de bemesting nog steeds past binnen de gebruiksnormen.