De hoge elektriciteitsprijzen hebben ook grote gevolgen voor ondernemers die subsidie krijgen via de regeling Stimulering Duurzame Energieproductie (en Klimaattransitie), de SDE+(+). De hoogte van de subsidie is gekoppeld aan de gemiddelde marktwaarde voor elektriciteit. Hoe hoger de marktwaarde, hoe minder subsidie. Er wordt dan namelijk meer ontvangen van de energieafnemer.
SDE-aanvragers ontvangen ieder jaar een voorschot. Na afloop van het jaar vindt er een correctie plaats op basis van de marktwaarde en de productiegegevens. Door de hoge elektriciteitsprijzen is de kans groot dat er te veel subsidie is ontvangen en er terugbetaald moet worden. Gezien de huidige marktprijzen kan dit oplopen tot het gehele voorschot.