Ouders van wie eerder het kindgebonden budget is stopgezet vanwege te veel inkomen, maar die later wel weer aan de voorwaarden voldeden, hadden toen automatisch weer kindgebonden budget moeten krijgen. Dat is in de periode 2013 – 2017 niet gebeurd, omdat het systeem ervan uitging dat de ouders daarvoor eerst zelf een nieuwe aanvraag moesten indienen. Honderdduizenden ouders hebben daardoor tussen 2013 en 2017 ten onrechte geen kindgebonden budget ontvangen. Staatssecretaris Van Ark heeft toegezegd dat het misgelopen kindgebonden budget wordt nabetaald.
De Belastingdienst/Toeslagen past eind 2019 de systemen aan, zodat over 2018 en 2019 het kindgebonden budget in voorkomende gevallen wel automatisch wordt herstart.
De budgettaire tegenvaller van de systeemfout wordt waarschijnlijk opgevangen door in 2020 het kindgebonden budget niet te indexeren.