Landbouwers kunnen onder voorwaarden een tegemoetkoming aanvragen voor schade aan landbouwgewassen of landbouwhuisdieren die is veroorzaakt door in het wild levende beschermde diersoorten. Aanvragen worden behandeld door BIJ12, de uitvoeringsinstantie namens de twaalf provincies. Om voor een tegemoetkoming in aanmerking te komen, moet de schade tijdig worden gemeld. Een aanvraag voor faunaschade moet binnen zeven werkdagen na constatering van de schade bij BIJ12 worden ingediend. Bij een vermoeden van schade door een wolf geldt een kortere termijn: deze schade moet zo spoedig mogelijk en uiterlijk binnen 24 uur na constatering worden gemeld. Daarnaast geldt dat de aanvrager redelijke maatregelen moet hebben genomen om schade te voorkomen of te beperken. BIJ12 beoordeelt per situatie of aan de voorwaarden is voldaan. In veel gevallen wordt een taxateur ingeschakeld om de omvang en oorzaak van de schade vast te stellen. Bij gewassen wordt alleen schade aan het hoofdproduct vergoed. Onlangs oordeelde de Raad van State dat een provincie bij schade aan rogge door wilde zwijnen terecht alleen een tegemoetkoming had toegekend voor de gemiste graankorrels en niet voor schade aan het stro.